The admissions process is conducted through the Doctoral School website system. The PhD student can apply to this specific project carried out as part of the Warsaw-4-PhD doctoral school via website https://shorturl.at/cJKQY (the application system will be activated from 19th of May 2025; deadline for sending application is 1st June, 2025. For more information, please follow the link https://shorturl.at/mvxOR

Projects available:

Apply

Learn about the scientific publications recognized in the Best Papers Awards – our internal competition honoring the most outstanding papers for their merit and significance.

 

2024

1. TENT5-mediated polyadenylation of mRNAs encoding secreted proteins is essential for gametogenesis in mice.

Authors: Brouze M, Czarnocka-Cieciura A, Gewartowska O, Kusio-Kobiałka M, Jachacy K, Szpila M, Tarkowski B, Gruchota J, Krawczyk P, Mroczek S, Borsuk E, Dziembowski A
Journal: Nature Communications
Link: https://www.nature.com/articles/s41467-024-49479-4

2. Pheromone-based animal communication influences the production of somatic extracellular vesicles in C. elegans.

Authors: Szczepańska A,* Olek K,* Kołodziejska K, Yu J, Ibrahim AT, Adamkiewicz L, Schroeder FC, Pokrzywa W, Turek M (* contributed equally)
Czasopismo: Nature Communications
Link: https://www.nature.com/articles/s41467-024-47016-x

3. Structure-functional characterization of Lactococcus AbiA phage defense system.

Authors: Gapińska M,* Zajko W,* Skowronek K, Figiel M, Krawczyk PS, Egorov AA, Dziembowski A, Johansson MJO, Nowotny M (* contributed equally)
Journal: Nucleic Acids Research
Link: https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae230/7642066?login=true

3. scRNA-seq reveals the diversity of the developing cardiac cell lineage and molecular players in heart rhythm regulation.

Authors: Abu Nahia K, Sulej A, Migdał M, Ochocka N, Ho R, Kamińska B, Zagorski M, Winata CL
Journal: iScience
Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004224013087?via%3Dihub

 

2023

1. Mechanism of RecF–RecO–RecR cooperation in bacterial homologous recombination.

Authors: Nirwal S, Czarnocki-Cieciura M, Chaudhary A, Zajko W, Skowronek K, Chamera S, Figiel M, Nowotny M.
Journal: Nature Structural & Molecular Biology
Link: https://www.nature.com/articles/s41594-023-00967-z

2. Impaired iron recycling from erythrocytes is an early hallmark of aging.

Authors: Slusarczyk P, Mandal PK, Zurawska G, Niklewicz M, Chouhan K, Mahadeva R, Jończy A, Macias M, Szybinska A, Cybulska-Lubak M, Krawczyk O, Herman S, Mikula M, Serwa R, Lenartowicz M, Pokrzywa W, Mleczko-Sanecka K.
Journal: eLife
Link: https://elifesciences.org/articles/79196

3. Lysine deserts and cullin-RING ligase receptors: Navigating untrodden paths in proteostasis.

Authors: Szulc NA, Piechota M, Biriczova L, Thapa P, Pokrzywa W.
Journal: iScience
Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223024215

 

2022

1. Structural basis of transposon end recognition explains central features of Tn7 transposition systems.

Authors: Kaczmarska Z, Czarnocki-Cieciura M, Górecka-Minakowska KM, Wingo RJ, Jackiewicz J, Zajko W, Poznański JT, Rawski M, Grant T, Peters JE, Nowotny M.
Journal:  Molecular Cell
Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276522004397?via%3Dihub

2. A heterotypic assembly mechanism regulates CHIP E3 ligase activity.

Authors: Das A, Thapa P, Santiago U, Shanmugam N, Banasiak K, Dąbrowska K, Nolte H, Szulc NA, Gathungu RM, Cysewski D, Krüger M, Dadlez M, Nowotny M, Camacho CJ, Hoppe T, Pokrzywa W.
Journal: The EMBO Journal
Link: https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embj.2021109566

3. Adar-mediated A-to-I editing is required for embryonic patterning and innate immune response regulation in zebrafish.

Authors: Niescierowicz K, Pryszcz L, Navarrete C, Tralle E, Sulej A, Abu Nahia K, Kasprzyk ME, Misztal K, Pateria A, Pakuła A, Bochtler M, Winata C.
Journal: Nature Communications
Link: https://www.nature.com/articles/s41467-022-33260-6

 

2021 

1. The GAS6-AXL signaling pathway triggers actin remodeling that drives membrane ruffling, macropinocytosis, and cancer-cell invasion.

Authors: Zdżalik-Bielecka D, Poświata A, Kozik K, Jastrzębski K, Schink KO, Brewińska-Olchowik M, Piwocka K, Stenmark H, Miączyńska M.
Journal: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS)
Link: https://www.pnas.org/content/118/28/e2024596118.long

2. Global view on the metabolism of RNA poly(A) tails in yeast Saccharomyces cerevisiae.

Authors: Tudek A, Krawczyk PS, Mroczek S, Tomecki R, Turtola M, Matylla-Kulińska K, Jensen TH, Dziembowski A.
Journal: Nature Communications
Link: https://www.nature.com/articles/s41467-021-25251-w

3. Cytoplasmic polyadenylation by TENT5A is required for proper bone formation.

Authors: Gewartowska O, Aranaz-Novaliches G, Krawczyk PS, Mroczek S, Kusio-Kobiałka M, Tarkowski B, Spoutil F, Benada O, Kofroňová O, Szwedziak P, Cysewski D, Gruchota J, Szpila M, Chlebowski A, Sedlacek R, Prochazka J, Dziembowski A.
Journal:  Cell Reports
Link: https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(21)00329-6?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124721003296%3Fshowall%3Dtrue

2020

1. Genome-wide mapping of SARS-CoV-2 RNA structures identifies therapeutically-relevant elements.  

Authors: Manfredonia I, Nithin C, Ponce-Salvatierra A, Ghosh P, Wirecki TK, Marinus T, Ogando NS, Snijder EJ, van Hemert MJ, Bujnicki JM. Incarnato D.
Journal: Nucleic Acids Research
Link: https://academic.oup.com/nar/article/48/22/12436/5961787

2. Origins of the increased affinity of phosphorothioate-modified therapeutic nucleic acids for proteins.

Authors: Hyjek-Składanowska M, Vickers T, Napiórkowska A, Anderson B, Tanowitz M, Crooke ST, Liang XH, Seth PP, Nowotny M.
Journal: Journal of the American Chemical Society
Link: https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jacs.9b13524#

3. Splicing variation of BMP2K balances abundance of COPII assemblies and autophagic degradation in erythroid cells.

Authors: Cendrowski J, Kaczmarek M, Mazur M, Kuzmicz-Kowalska K, Jastrzebski K, Brewinska-Olchowik M, Kominek A, Piwocka K, Miaczynska M.
Journal:  eLife
Link: https://elifesciences.org/articles/58504

2019 

1. Synthetic lethality between VPS4A and VPS4B triggers an inflammatory response in colorectal cancer.

Authors: Szymańska E, Nowak P, Kolmus K, Cybulska M, Goryca K, Derezińska-Wołek E, Szumera-Ciećkiewicz A, Brewińska-Olchowik M, Grochowska A, Piwocka K, Prochorec-Sobieszek M, Mikula M, Miączyńska M.
Journal: EMBO Molecular Medicine
Link: https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/emmm.201910812

2. TrkB hyperactivity contributes to brain dysconnectivity, epileptogenesis, and anxiety in zebrafish model of Tuberous Sclerosis Complex.

Authors: Kedra M, Banasiak K, Kisielewska K, Wolinska-Niziol L, Jaworski J, Zmorzynska J.
Journal: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS)
Link: https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.1910834117

3. RuvC uses dynamic probing of the Holliday junction substrate to achieve sequence specificity and efficient resolution.

Authors: Górecka KM, Krepl M, Szlachcic A, Poznański J, Šponer J, Nowotny M.
Journal:  Nature Communications
Link: https://www.nature.com/articles/s41467-019-11900-8

The admissions process is conducted through the Doctoral School website system. The PhD student can apply to this specific project carried out as part of the Warsaw-4-PhD doctoral school via website https://shorturl.at/cJKQY (the application system will be activated from 19th December 2024; deadline for sending application is 6th January 2025). For more information, please follow the link https://shorturl.at/mvxOR 

Projects available to apply:

Apply

The admissions process is conducted through the Doctoral School website system. The PhD student can apply to this specific project carried out as part of the Warsaw-4-PhD doctoral school via website https://shorturl.at/cJKQY (the application system will be activated from 19th December 2024; deadline for sending application is 6th January 2025). For more information, please follow the link https://shorturl.at/mvxOR 

Projects available to apply:

Apply

The Final Symposium on GRIEG Projects, which took place online on 17th September 2024, gave us an insights into two GRIEG projects funded by the Norwegian Financial Mechanism 2014-2021:

"Cellular adaptation to cold" (CellCOLD), led by Wojciech Pokrzywa, PhD, DSc Habil.

"The impact of cytoplasmic polyadenylation on local translation in neurons", led by Prof. Andrzej Dziembowski.

Wojciech Pokrzywa presented focus of his project - investigating the mechanisms of cold stress adaptation using C. elegans as a model organism. Natalia Gumińska, PhD presented the focus of the second project - understanding how cytoplasmic polyadenylation regulates neuronal functions related to memory and learning.

The progress and research achievements made under the GRIEG projects highlight the power of local and international collaboration, as the projects were implemented with a strong contribution from Polish partner at the University of Warsaw, and Norwegian partners located at the University of Oslo and the University of Bergen.

Key Achievements of both projects are:

9 peer-reviewed publications

20 presentations at international conferences

25 researchers supported in basic research

9 mentor-mentee relationships across both projects established​

2 joint grant applications

summary-grieg-pokrzywa.png

 

Technology Transfer Office

Technology Transfer Office (TTO) created as one of the pillars of the RACE project is committed to supporting IIMCB’s researches in identifying and developing scientific discoveries that can be turned into solutions for patients and society. IIMCB’s efforts in becoming a unique Center of Excellence is supported by the advice of EU-LIFE working groups and the Commercialization Advisory Committee (CAC). CAC is composed of international experts in science valorization, including our advanced partners from VIB and the University of Edinburgh.

Building Partnerships for Innovation
We are constantly building our expertise to provide professional support in intellectual property rights protection, science valorization and commercialization for IIMCB’s scientists. Building network and collaboration with local and international academic and industrial partners are one of the main activities of the TTO in the mission of transferring great scientific innovations into solutions that can benefit the society. 

Our Team:
Kornelia Mikuła, PhD – Head of Technology Transfer Office, responsible for identifying industry partners, contract drafting and negotiations (research collaborations, licensing, MTA, CDA/NDA, service).
Paweł Botwina, PhD – Innovation Specialist, responsible for assessing patentability of new innovations, patent drafting and prosecution.

Contact Us
If you are interested in partnering, collaboration, or licensing, please contact our Tech Transfer Team at: 
This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Projekt "RNA i Biologia Komórki – od Badań Podstawowych do Terapii" (RACE)

Od laboratorium do pacjenta: MIBMiK rozpoczyna nowy etap rozwoju

 

Pełna informacja o projekcie dostępna na angielskiej stronie: https://www.iimcb.gov.pl/en/race

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie (MIBMiK) zainaugurował program RACE (akronim od RNA and Cell Biology – from Fundamental Research to Therapies), którego celem jest przekształcenie warszawskiego Instytutu w światowej klasy centrum doskonałości w obszarze biologii RNA i biologii komórki.

RACE kick off

W uroczystości, która odbyła się 10 stycznia 2024 r. w Warszawie, wzięli udział między innymi ambasador Wielkiej Brytanii  w Polsce Anna Clunes, przedstawiciel rządu Flandrii i ambasady Belgii Tejs Verstrate, wiceprezydent Warszawy Michał Olszewski, prezes Fundacji na rzecz Nauki Polskiej prof. Maciej Żylicz, liczni luminarze europejskiej i polskiej nauki oraz kadra Międzynarodowego Instytutu Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie.

Program RACE kładzie nacisk na translacyjność badań, oznaczającą zdolność do praktycznego wykorzystania wiedzy naukowej, zgodnie z zasadą „od laboratoryjnego stołu do łóżka pacjenta”. Szczególne nadzieje wiązane są z technologią mRNA, w której specjalizuje się warszawski Instytut. Ta stosunkowo nowa metoda terapeutyczna już znalazła zastosowanie w szczepionkach przeciwko Covid 19. Obecnie trwają prace nad jej użyciem w leczeniu nowotworów oraz chorób zakaźnych.

Dodatkowo, MIBMiK liczy na pozyskanie utalentowanych naukowców, co pozwoli na wykształcenie nowej generacji liderów nauki oraz zaowocuje licznymi patentami i grantami. Program RACE zakłada także rozwój usług komercyjnych, opracowanie aplikacji medycznych w oparciu o wyniki badań MIBMiK i pełną digitalizację pracy administracji. Jednym z elementów programu jest także budowa nowoczesnej siedziby Instytutu, dzięki której MIBMiK spełni wymagania stawiane przed centrum doskonałości w dziedzinie biologii RNA i biologii komórki.

W ramach realizacji programu RACE, warszawski Instytut będzie blisko współpracował z instytucjami partnerskimi: Zakładem Genetyki Człowieka Uniwersytetu w Edynburgu (MRC Human Genetics Unit of the University of Edinburgh) oraz Flamandzkim Instytutem Biotechnologii VIB (Flanders Institute for Biotechnology VIB) w Belgii.

Minister Nauki Dariusz Wieczorek skierował na ręce prof. Marty Miączyńskiej, dyrektor MIBMiK, list  gratulacyjny. Wskazał, że poprzez swoje działania MIBMiK będzie się włączał  w realizację strategii dla rozwoju przemysłu biotechnologicznego w Polsce – Oznacza to, iż będziemy mieli w kraju doskonały ośrodek wzmacniający odporność gospodarki i społeczeństwa na zagrożenia wynikające z przyszłych, możliwych kryzysów pandemicznych czy związanych z chorobami cywilizacyjnymi.  To wszystko prowadzi do konkluzji, że skuteczna realizacja projektu RACE będzie jednym z bardziej istotnych przedsięwzięć na naukowej  i innowacyjnej mapie Polski – napisał minister Dariusz Wieczorek.

– Jesteśmy niezmiernie dumni z pozyskania funduszy na program RACE od Komisji Europejskiej. Nasz program został oceniony bardzo wysoko, został sklasyfikowany jako numer jeden na europejskiej liście rankingowej  – powiedziała prof.  Marta Miączyńska, dyrektor Międzynarodowego Instytutu Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie, a także koordynatorka RACE. Prof. Miączyńska wyraziła również uznanie dla Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego oraz Fundacji na rzecz Nauki Polskiej, które zapewnią dodatkowe fundusze na program.    

– W 2020 roku Wielka Brytania była piątym największym partnerem polskich instytucji naukowych. Liczę że w przyszłości zobaczymy więcej takich inicjatyw – powiedziała ambasador Wielkiej Brytanii w Polsce, Anna Clunes. Jak podkreśliła, dla Wielkiej Brytanii inżynieria biomedyczna jest jedną  z kluczowych technologii. Rząd Zjednoczonego Królestwa planuje zainwestować w ten sektor 2 miliardy funtów w ciągu najbliższych 10 lat. – Inżynieria biomedyczna ma potencjał tworzenia terapii indywidualnych i programy takie jak RACE przysłużą się zdrowiu w Polsce, Wielkiej Brytanii, Belgii oraz na całym świecie – powiedziała ambasador Wielkiej Brytanii.

Głos zabrał także Tejs Verstrate z ambasady Belgii, reprezentant rządu Flandrii w Polsce i Krajach Bałtyckich. Zwrócił on uwagę na fakt, że nakłady na badania i rozwój (B+R) służą budowie społeczeństwa opartego na wiedzy. Jak poinformował, B+R odpowiadają w jego kraju za 3% PKB i stale rosną (wg. GUS w Polsce w 2022 r. wskaźnik ten wyniósł 1,46%). Instytut VIB, partner warszawskiego MIBMiK, jest jednym z najbardziej innowacyjnych ośrodków w Belgii, posiadającym wyjątkowe doświadczenie w budowaniu skutecznych kooperacji z innymi placówkami. Jak podkreślił prelegent  z Belgii, przez następne 6 lat VIB będzie pracować przy projekcie RACE, który uczyni z MIBMiK światowej klasy centrum doskonałości.

Federica Roffi z Europejskiej Agencji Wykonawczej ds. Badań Naukowych (REA) pod auspicjami Komisji Europejskiej poinformowała, że w ostatnich latach znacznie zaostrzyła się konkurencja o środki w ramach programu Horizon Europe. Pogratulowała warszawskiemu Instytutowi, który z programem RACE znalazł się w prestiżowym gronie 12 laureatów programu, z ogólnej liczby 115 wniosków. Przedstawicielka Komisji Europejskiej wyraziła przekonanie, że unijne wsparcie dla programu RACE  w wysokości 15 mln EUR przyczyni się do rozwoju MIBMiK oraz wzmocni europejską sieć współpracy.  – Rozwój centrów doskonałości opiera się na kilku głównych czynnikach: najwyższej jakości badaniach i rozwoju, odpowiednim finansowaniu, analizie wskaźników efektywności, niezależności oraz międzynarodowej rekrutacji – zauważyła Federica Roffi.

Prof. Maciej Żylicz, prezes Fundacji na rzecz Nauki Polskiej, poruszył kwestię drenażu mózgów, czyli wyjazdów najbardziej uzdolnionych naukowców za granicę. Jego zdaniem, właśnie tworzenie centrów doskonałości, takich jak MIBMiK, jest receptą na zapobieganie odpływowi najlepszych kadr. Co więcej, może przyciągać talenty zarówno z kraju, jak i z zagranicy.

– Jestem bardzo podekscytowana tym, co możemy zrobić wspólnie –  powiedziała prof. Wendy Bickmore z Uniwersytetu w Edynburgu. Także dr. Geert Van Minnebruggen reprezentujący flamandzki instytut VIB podkreślił kluczową rolę współpracy wielu podmiotów dla rozwoju nauki. – Jesteśmy dumni z kolaboracji z MIBMiK – wskazał.

Po części oficjalnej odbyła się debata z udziałem naukowców z różnych dziedzin (chemia, fizyka nuklearna, biologia), którą prowadziła prof. Marta Miączyńska. Kinga Słonimska z Fundacji na rzecz Nauki Polskiej przyznała, że pozyskiwanie utalentowanych kadr naukowych z zagranicy jest trudne, jednak możliwe. – Chciałabym zobaczyć ten aspekt wzmocniony. Współpraca MIBMiK z Edynburgiem  i belgijskim VIB z pewnością będzie przyciągać nowych naukowców – mówiła prelegentka.

Prof. Jacek Jemielity z Uniwersytetu Warszawskiego, prezes ExploRNA Therapeutics, podkreślił znaczenie badań podstawowych nad RNA. – RNA to fascynująca molekuła, która posiada potencjał terapeutyczny; potencjał tej technologii jest wielki, ale potwierdzenie technologii w innych obszarach wymaga jej rozwoju, dlatego wracamy do badań podstawowych. Program RACE to inwestycja  w badania podstawowe – podsumował prof. Jemielity.  

Prof. Leszek Kaczmarek z Instytutu Biologii Doświadczalnej im. Marcelego Nenckiego PAN uważa, że Polska nie może sobie pozwolić na marnowanie potencjału młodych naukowców. Równie ważne jest stabilne i długofalowe finansowanie, aby zapewnić rozwój i dążenie do doskonałości. Zgodził się z nim prof. Paweł Sobkowicz z Narodowego Centrum Badań Jądrowych. Podkreślił, że odpowiednie finansowanie jest niezbędne, także aby zatrzymać odpływ talentów i przyciągnąć młodych ludzi  z potencjałem – To na nich wszyscy polegamy – podsumował. 

RACE galeria zdjec

RACE pasek logo

Funded by the European Union. Views and opinions expressed are however those of the author(s) only and do not necessarily reflect those of the European Union or the European Research Executive Agency. Neither the European Union nor the granting authority can be held responsible for them.