All publications

2025

Publication

Re-adenylation by TENT5A enhances efficacy of SARS-CoV-2 mRNA vaccines.

Krawczyk PS, Mazur M, Orzeł W, Gewartowska O, Jeleń S, Antczak W, Kasztelan K, Brouze A, Matylla-Kulińska K, Gumińska N, Tarkowski B, Owczarek EP, Affek K, Turowski P, Tudek A, Sroka M, Śpiewla T, Kusio-Kobiałka M, Wesołowska A, Nowis D, Golab J, Kowalska J, Jemielity J, Dziembowski A, Mroczek S.

Nature. 2025

Publication

Direct profiling of non-adenosines in poly(A) tails of endogenous and therapeutic mRNAs with Ninetails.

Gumińska N, Matylla-Kulińska K, Krawczyk PS, Maj M, Orzeł W, Mackiewicz Z, Brouze A, Mroczek S, Dziembowski A.

Nat Commun. 2025

Publication

Terminal nucleotidyltransferase Tent2 microRNA A-tailing enzyme regulates excitatory/inhibitory balance in the hippocampus.

Wardaszka-Pianka P, Kuzniewska B, Guminska N, Hojka-Osinska A, Puchalska M, Milek J, Stawikowska A, Krawczyk P, Pauzin FP, Wojtowicz T, Radwanska K, Bramham CR, Dziembowski A, Dziembowska M.

RNA. 2025

Publication

DIS3L, cytoplasmic exosome catalytic subunit, is essential for development but not cell viability in mice.

Brouze M, Szpila M, Czerwińska AM, Antczak W, Mroczek S, Kuliński T, Hojka-Osińska AM, Cysewski D, Gewartowska O, Adamska D, Gruchota J, Borsuk E, Dziembowski A.

RNA. 2025

Publication

Comprehensive analysis of poly(A) tails in mouse testes and ovaries using Nanopore Direct RNA Sequencing.

Czarnocka-Cieciura A, Brouze M, Gumińska N, Mroczek S, Gewartowska O, Krawczyk PS, Dziembowski A.

Sci Data. 2025

Publication

5′ terminal nucleotide determines the immunogenicity of IVT RNAs.

Wolczyk M, Szymanski J, Trus I, Naz Z, Tame T, Bolembach A, Choudhury NR, Kasztelan K, Rappsilber J, Dziembowski A, Michlewski G.

Nucleic Acids Res. 2025

Publication

Zygotic activin a is dispensable for the mouse preimplantation embryo development and for the derivation and pluripotency of embryonic stem cells.

Winek E, Wolińska-Nizioł L, Szczepańska K, Szpakowska A, Gewartowska O, Wysocka I, Grzesiak M, Suwińska A.

Biol Reprod. 2025

Publication

Ecological interactions in glacier environments: a review of studies on a model Alpine glacier.

Crosta A, Valle B, Caccianiga M, Gobbi M, Ficetola FG, Pittino F, Franzetti A, Azzoni RS, Lencioni V, Senese A, Corlatti L, Buda J, Poniecka E, Novotná Jaroměřská T, Zawierucha K, Ambrosini R.

Biol Rev. 2025

2024

Publication

Modeling of mRNA deadenylation rates reveal a complex relationship between mRNA deadenylation and decay.

Czarnocka-Cieciura A, Poznański J, Turtola M, Tomecki R, Krawczyk PS, Mroczek S, Orzeł W, Saha U, Jensen TH, Dziembowski A, Tudek A.

EMBO J. 2024

Publication

Transcriptome-Wide Analysis of mRNA Adenylation Status in Yeast Using Nanopore Sequencing.

Krawczyk PS, Tudek A, Mroczek S, Dziembowski A.

Methods Mol Biol. 2024

Publication

TENT5-mediated polyadenylation of mRNAs encoding secreted proteins is essential for gametogenesis in mice.

Brouze M, Czarnocka-Cieciura A, Gewartowska O, Kusio-Kobiałka M, Jachacy K, Szpila M, Tarkowski B, Gruchota J, Krawczyk P, Mroczek S, Borsuk E, Dziembowski A.

Nat Commun. 2024

Publication

Structure-functional characterization of Lactococcus AbiA phage defense system.

Gapińska M, Zajko W, Skowronek K, Figiel M, Krawczyk PS, Egorov AA, Dziembowski A, Johansson MJO, Nowotny M.

Nucleic Acids Res. 2024

Publication

Circular extrachromosomal DNA in Euglena gracilis under normal and stress conditions.

Gumińska N, Hałakuc P, Zakryś B, Milanowski R.

Protist. 2024

Publication

Mutation in the mitochondrial chaperone TRAP1 leads to autism with more severe symptoms in males.

Rydzanicz M, Kuzniewska B, Magnowska M, Wójtowicz T, Stawikowska A, Hojka A, Borsuk E, Meyza K, Gewartowska O, Gruchota J, Miłek J, Wardaszka P, Chojnicka I, Kondrakiewicz L, Dymkowska D, Puścian A, Knapska E, Dziembowski A, Płoski R, Dziembowska M.

EMBO Mol Med. 2024

2023

Identification of cardiac-related serum miRNA in patients with type 2 diabetes mellitus and heart failure: Preliminary report.

Wrzosek M, Hojka-Osińska A, Klimczak-Tomaniak D, Żarek-Starzewska AK, Dyrla W, Rostek-Bogacka M, Wróblewski M, Kuch M, Kucia M.

Adv Clin Exp Med.. 2023

Preprint

Multiple Myeloma associated DIS3 mutations drive AID-dependent IgH Translocations.

Kulinski TM, Gewartowska O, Mahe M, Kasztelan K, Durys J, Seraphin B, Dziembowski A.

bioRxiv. 2023

Preprint

mRNA decay can be uncoupled from deadenylation during stress response.

Czarnocka-Cieciura A, Turtola M, Tomecki R, Krawczyk P, Mroczek S, Orzeł W, Saha U, Jensen TH, Dziembowski A, Tudek A.

bioRxiv. 2023

Measuring the tail: Methods for poly(A) tail profiling.

Brouze A, Krawczyk PS, Dziembowski A, Mroczek S.

Wiley Interdiscip Rev RNA.. 2023

2022

Publication

TENT5 cytoplasmic noncanonical poly(A) polymerases regulate the innate immune response in animals.

Liudkovska V, Krawczyk PS, Brouze A, Gumińska N, Wegierski T, Cysewski D, Mackiewicz Z, Ewbank JJ, Drabikowski K, Mroczek S, Dziembowski A.

Sci Adv. 2022

Publication

Disrupting interaction between miR-132 and Mmp9 3'UTR improves synaptic plasticity and memory in mice.

Kuzniewska B, Rejmak K, Nowacka A, Ziółkowska M, Milek J, Magnowska M, Gruchota J, Gewartowska O, Borsuk E, Salamian A, Dziembowski A, Radwanska K, Dziembowska M.

Front Mol Neurosci. 2022

Publication

A long noncoding RNA promotes parasite differentiation in African trypanosomes.

Guegan F, Rajan KS, Bento F, Pinto-Neves D, Sequeira M, Gumińska N, Mroczek S, Dziembowski A, Cohen-Chalamish S, Doniger T, Galili B, Estévez AM, Notredame C, Michaeli S, Figueiredo LM.

Sci Adv. 2022

2021

Three-layered control of mRNA poly(A) tail synthesis in Saccharomyces cerevisiae.

Turtola M, Manav MC, Kumar A, Tudek A, Mroczek S, Krawczyk PS, Dziembowski A, Schmid M, Passmore LA, Casañal A, Jensen TH.

Genes Dev.. 2021

The TUTase URT1 connects decapping activators and prevents the accumulation of excessively deadenylated mRNAs to avoid siRNA biogenesis.

Scheer H, de Almeida C, Ferrier E, Simonnot Q, Poirier L, Pflieger D, Sement FM, Koechler S, Piermaria C, Krawczyk P, Mroczek S, Chicher J, Kuhn L, Dziembowski A, Hammann P, Zuber H, Gagliardi D.

Nat Commun.. 2021

Global view on the metabolism of RNA poly(A) tails in yeast Saccharomyces cerevisiae.

Tudek A, Krawczyk PS, Mroczek S, Tomecki R, Turtola M, Matylla-Kulińska K, Jensen TH, Dziembowski A.

Nat Commun. . 2021

Cytoplasmic polyadenylation by TENT5A is required for proper bone formation.

Gewartowska O, Aranaz-Novaliches G, Krawczyk PS, Mroczek S, Kusio-Kobiałka M, Tarkowski B, Spoutil F, Benada O, Kofroňová O, Szwedziak P, Cysewski D, Gruchota J, Szpila M, Chlebowski A, Sedlacek R, Prochazka J, Dziembowski A.

Cell Rep.. 2021

Functions and mechanisms of RNA tailing by metazoan terminal nucleotidyltransferases.

Liudkovska V, Dziembowski A.

Wiley Interdiscip Rev RNA.. 2021

2020

Structure and mechanism of CutA, RNA nucleotidyl transferase with an unusual preference for cytosine..

Malik D, Kobyłecki K, Krawczyk P, Poznański J, Jakielaszek A, Napiórkowska A, Dziembowski A, Tomecki R, Nowotny M.

Nucleic Acids Res.. 2020

Mitochondrial protein biogenesis in the synapse is supported by local translation.

Kuzniewska B, Cysewski D, Wasilewski M, Sakowska P, Milek J, Kulinski TM, Winiarski M, Kozielewicz P, Knapska E, Dadlez M, Chacinska A, Dziembowski A, Dziembowska M.

EMBO Rep.. 2020

Immunoglobulin Expression and the Humoral Immune Response Is Regulated by the Non-Canonical poly(A) Polymerase TENT5C.

Bilska A, Kusio-Kobiałka M, Krawczyk PS, Gewartowska OTarkowski B, Kobyłecki K, Nowis D, Golab J, Gruchota J, Borsuk E, Dziembowski A, Mroczek S.

Nat Commun.. 2020