Dyrektor
- Biuro Dyrekcji
- Pełnomocnik ds. Transformacji Organizacyjnej
- Dział Zarządzania Zasobami Ludzkimi
- Projekt Strategiczny Aurezyna
- Samodzielne stanowisko pracy ds. BHP
- Dział Kontrolingu
- Archiwum Zakładowe
Program Pracowni Usługowych IN-MOL-CELL: - Pracownia Bioinformatyki
- Pracownia Biofizyki i Bioanalityki
- Pracownia Genomiki
- Pracownia Hodowli Gryzoni
- Pracownia Hodowli Ryb
- Pracownia Inżynierii Genomu
- Pracownia Mikroskopii
- Pracownia Cytometrii i Modeli Komórkowych
- Pracownia Przedklinicznego Badania Leków
- Pracownia Spektrometrii Mas
Zastępca Dyrektora ds. Rozwoju
- Biuro Spraw Doktoranckich
- Biuro Komunikacji
- Dział Koordynacji Naukowej
- Biuro Transferu Technologii
- BioCentrum Edukacji Naukowej
Zastępca Dyrektora ds. Naukowych
- Laboratorium Biologii Strukturalnej
- Laboratorium Wirusów RNA
- Laboratorium Bioinformatyki i Inżynierii Białka
- Laboratorium Biologii RNA - Grupa ERA Chairs
- Laboratorium Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej
- Laboratorium Genomiki Komórkowej
- Laboratorium Neurodegeneracji
- Laboratorium Regulacji Genów Prokariotycznych
- Laboratorium Biologii Komórki
- Laboratorium Oddziaływań RNA-Białko - Centrum Dioscuri
- Laboratorium Homeostazy Żelaza
- Laboratorium Struktury Białka
- Laboratorium Metabolizmu Białek
- Laboratorium Genomiki Rozwoju Danio Pręgowanego
- Laboratorium Proteostazy Komórkowej
- Laboratorium Splicingu RNA
- Dział Grantów
Zastępca Dyrektora ds. Finansowych / Główny Księgowy
- Dział Finansowo-Księgowy
Zastępca Dyrektora ds. Operacyjnych
- Dział Informatyczny
- Dział Operacyjny
- Dział Zamówień Publicznych