Badania strukturalne białek herpeswirusowych zaangażowanych w replikację DNA – to tytuł projektu dr Małgorzaty Figiel z Laboratorium Struktury Białka, na którego realizację otrzymała ona grant z funduszy Narodowego Centrum Nauki. Wysokość grantu wynosi 2 047 255 PLN i będzie on realizowany przez okres 4 lat. Serdecznie gratulujemy!
Celem projektu jest umożliwienie lepszego zrozumienia procesu replikacji DNA u herpeswirusów, które należą do jednych z najbardziej rozpowszechnionych patogenów występujących u ludzi. Co prawda, nie stanowią one większego zagrożenia dla osób zdrowych, ale mogą wywoływać ciężkie choroby u pacjentów z obniżoną odpornością.
Pomimo obszernych danych biochemicznych dotyczących białek replikacyjnych herpeswirusów, dotychczasowe rozumienie replikacji DNA w herpeswirusach jest nadal niepełne. Nie określono jeszcze struktur kilku z tych białek. Co więcej, nie wiadomo, w jaki sposób białka te są rekrutowane do widełek replikacyjnych i jak sprzężona jest synteza obu nici DNA. Ponadto brakuje informacji strukturalnych o oddziaływaniach białek tworzących maszynerię replikacyjną HSV-1 między sobą i z ich substratami w postaci kwasów nukleinowych. Z tego powodu architektura kompletnego replisomu lub nawet jego części nadal pozostaje nieznana.
Zespół badawczy pod przewodnictwem dr Figiel planuje określić - przy użyciu mikroskopii krioelektronowej (cryo-EM) i krystalografii rentgenowskiej - struktury atomowe białek herpeswirusów, zaangażowanych w replikację DNA oraz ich kompleksów z odpowiednimi substratami (kwasami nukleinowymi).
Jak dodaje dr Figiel – powyższe badania strukturalne będą uzupełnione eksperymentami biochemicznymi. – Na podstawie struktur i danych biochemicznych pokażemy, jak działa replisom herpeswirusów oraz jak regulowana i koordynowana jest aktywność jego komponentów. Wyniki tego projektu będą cennym źródłem informacji dla przyszłych działań badawczych zmierzających do uzyskania nowych leków przeciw herpeswirusom – wyjaśnia dr Małgorzata Figiel.